人類日常食用的天然蝦蟹、魚類等水生動物中皆含有豐富的天然蝦青素，人類日常食用沒有出現不良反應和中毒癥狀，故天然蝦青素對人類和動物是安全的，試驗也證明了這一點。美國某公司經過系統的人體安全性試驗，對2組健康成年人每天分別以19.25mg和3.85mg劑量服用雨生紅球藻粉補充蝦青素，試驗后經過詳細監測以及全面分析，口服富含天然蝦青素的雨生紅球藻藻粉對人體無致病效應或毒副作用。但化學合成蝦青素，由于合成過程可能被其他有害物質污染，產品中還含有大量的順式異構體，其生物利用安全性降低，因此化學合成的蝦青素在食品、飼料、醫藥品及化妝品上的應用受到很大的限制。