蝦青素最大的市場是在飼料工業，它可以作為主要用作魚類（鮭魚、鱘魚、虹鱒魚、真鯛等）和蝦蟹等甲殼類動物及家禽的飼料添加劑。蝦青素作為水產養殖動物的著色劑，可以使水生動物呈現鮮艷的色澤，使其具有更高的觀賞性；在家禽飼料中添加蝦青素可增加雞蛋蛋黃色素含量；它還可以提高母雞的產蛋率，促進蛋雞的健康。蝦青素在防治魚類、蝦蟹及禽類疾病方面有與對人類同樣的功用，可提高免疫力、提高成活率，對其正常生長和健康養殖、提高存活率及繁殖率具有重要的作用。蝦青素還能夠增加魚類的風味，其可直接作為形成鮭魚食品風味的前體化合物，也可促進脂肪酸或其他脂類前體物轉化成鮭魚的風味化合物。